Hola Renzo, me atrevo a contestarte desde mi inexperiencia.
Suponiendo que tienes un amplificador con el que estás acostumbrado a tocar y un microfono (mas o menos bueno); y también tienes tu placa y tu secuenciador que puede ser cubase o cualquier otro, y necesariamente un plugin vst que simule de amplificador de la guitarra, con cual crees que sonará mejor?
Bueno, es cuestión de gustos por ahi, pero con el microfono captaras el sonido real de tu amplificador que probablemente suene mejor que algo grabado directamente a la placa y filtrado por ej con Guitar Rig o Amplitube, que puede ser bueno igual pero tendrá mucho que ver en como explotes ese programa VSt sumado a tu tecnica y demas que bue.. son otro tema.
Yo grabo mi guitarra y bajo conectados directamente a la placa de audio y utilizando Amplitube 3 (que trae muchos presets de amplificadores, efectos, incluso un afinador) porque no tengo amplificador.
Pero si tuviera un buen amplificador y unos buenos microfonos experimentaria la diferencia entre grabar de las dos maneras.
De todas formas, creo yo la que verdaderamente es «la correcta» es grabar con microfonos captando al amplificador.
Saludos, hueso